Qué es la secuenciación NGS
NGS son las siglas en inglés de secuenciación de nueva generación: una técnica que lee el ADN (y a veces el ARN) del tumor en muchos genes a la vez. Antes cada gen se analizaba por separado; ahora un solo panel puede estudiar desde 20-50 genes (paneles "dirigidos") hasta más de 500 (paneles "amplios" o comprehensive). El objetivo es encontrar alteraciones accionables: cambios que tienen un fármaco aprobado o un ensayo clínico.
Qué debería incluir en cáncer colorrectal
| Alteración | Para qué sirve saberlo |
|---|---|
| KRAS / NRAS | Si están mutados, no sirven los anti-EGFR. Si es KRAS G12C, hay fármacos específicos. |
| BRAF V600E | Encorafenib + cetuximab; pronóstico distinto. |
| MSI / MMR | Inmunoterapia; descartar síndrome de Lynch. |
| HER2 (amplificación) | Terapias anti-HER2; los anti-EGFR funcionan peor. |
| NTRK (fusiones) | Muy raras (<1 %), pero con fármacos muy eficaces (larotrectinib, entrectinib). Más frecuentes en tumores MSI-H RAS/BRAF nativos. |
| PIK3CA, MET, RET, ALK, ROS1 | Sin tratamiento estándar en colon, pero abren ensayos clínicos. |
| TMB (carga mutacional) | Orienta sobre inmunoterapia en algunos casos; en colon pesa menos que MSI. |
| POLE / POLD1 | Raras; tumores con muchísimas mutaciones que responden a inmunoterapia. |
Las guías europeas (ESMO) consideran obligatorio en enfermedad metastásica estudiar RAS, BRAF y MSI, y recomiendan HER2; el panel NGS amplio se recomienda sobre todo cuando se buscan ensayos clínicos o se han agotado las líneas estándar.
Tejido o sangre
- Tejido (biopsia o pieza quirúrgica guardada en parafina): es el estándar. Sirve material de hace años, aunque el tumor puede haber cambiado desde entonces.
- Sangre (biopsia líquida): analiza el ADN que el tumor suelta en la sangre. Es rápida y no invasiva, refleja el tumor actual, pero puede dar falsos negativos si el tumor libera poco ADN. Se usa cuando no hay tejido suficiente o para comprobar RAS antes de reutilizar un anti-EGFR.
Los resultados tardan normalmente 2-4 semanas. Si el tratamiento no puede esperar, se empieza con lo que se sabe y se ajusta después.
Cómo pedirlo
- Pregunta primero qué se ha hecho ya. Muchas veces RAS, BRAF y MSI están en el informe de anatomía patológica y lo que falta es HER2 o el panel amplio.
- Pídelo en consulta de forma concreta: "¿Se me ha hecho un panel NGS? Si no, ¿se puede solicitar?". La mayoría de los hospitales grandes lo hacen en su propio laboratorio o lo envían a un centro de referencia de su comunidad; los hospitales pequeños derivan la muestra.
- Si te dicen que no está disponible: pregunta si pueden enviar la muestra a otro centro público, si hay un ensayo que incluya el estudio molecular (los screening de ensayos lo hacen gratis), o si existe un programa de acceso de algún laboratorio. Las unidades de ensayos fase I suelen hacer paneles amplios a los pacientes que valoran.
- Por lo privado: varios laboratorios ofrecen paneles amplios sobre tejido o sangre; el coste varía mucho. Si lo haces, pide que el informe llegue a tu oncólogo para que lo interprete y que la muestra la gestione el hospital.
Cómo leer el informe
- Busca el apartado de alteraciones accionables o "clínicamente relevantes": son las que tienen fármaco o ensayo.
- Muchos informes clasifican la evidencia con la escala ESCAT (ESMO): nivel I = tratamiento aprobado para tu tumor; II-III = evidencia en estudios o en otros tumores (ensayos); IV-V = sin utilidad clínica demostrada hoy.
- Las "variantes de significado incierto" (VUS) no cambian nada por ahora.
- Si aparece una alteración germinal (heredada) posible, te derivarán a consejo genético.
- El informe suele listar ensayos clínicos que buscan tus alteraciones; cruza esa lista con los que reclutan en España en nuestro buscador.
Qué preguntar en la consulta
- ¿Qué alteraciones moleculares se han estudiado ya en mi tumor y con qué resultado?
- ¿Me falta HER2 o un panel amplio? ¿Se puede pedir aquí o hay que derivar la muestra?
- ¿Tejido o sangre? ¿Cuánto tardará y empezamos tratamiento mientras tanto?
- ¿Alguna de mis alteraciones tiene fármaco aprobado o ensayo abierto en España?
- ¿Hay algo en el informe que sugiera una alteración hereditaria?